睡醒全身酸疼可能是疲劳过度或参加剧烈运动有关，身体的肌肉会代谢大量的乳酸，并且在夜间代谢效率降低后造成乳酸堆积引起酸疼症状出现。
其次，可见于夜间的睡姿造成肌肉挤压或牵拉损伤后引起的疼痛，一般在起床后通过局部活动可以缓解。如果肌肉诱发了劳损伤害不能及时干预治疗就容易造成无菌性炎症诱发肌筋膜炎，也会导致身体出现肌肉疼痛，需要进行消炎消肿治疗。
在夜间睡觉时首先要保证良好的睡姿，还要做好局部保暖，可以避免晨起后出现酸痛不适的症状。