对于新冠肛拭子检测并不适合所有的人群，因为考虑到肛拭子采集不如咽拭子便捷，而且涉及到人群的隐私部位，目前只对隔离点、重点人群、密切接触的人群，或者是在隔离点进行排阴的检查人群，或者在隔离点隔离完毕要进行解脱隔离的人群进行采集。
在采肛拭子的时候，同时要对咽拭子进行采集，因为对于一些无症状感染者或者轻症的感染者来讲，感染后病情得以恢复，但是可能在三天到五天左右咽部检测不到核算，但是患者的粪便、肛拭子核酸会有可能持续的时间比呼吸道持续时间更强，因此，肛拭子的采集是为了减少漏诊。