痢疾主要由菌痢引起，被志贺杆菌感染，因此肠杆菌和志贺氏菌是兼性厌氧革兰氏阴性菌，有菌毛，无鞭毛。
它们是痢疾志贺菌和鲍氏志贺菌和福氏志贺菌和宋氏志贺菌。主要感染源为痢疾志贺氏菌、福氏志贺氏菌合并痢疾患者及细菌性痢疾携带者。
主要传播途径是痢疾杆菌随病人或带有细菌的粪便排出，然后通过污染水、手、食物、水或生活接触物或苍蝇、蟑螂等间接传播，最后经口进入消化道，使易感者受到感染，使人感染一般容易感染痢疾杆菌。