面肌痉挛手术后一般不会有后遗症。这种手术是在显微镜下操作的，是需要通过手术将压迫神经的血管隔开，手术造成的损伤很小，治愈率高，通常不会导致术后的后遗症。
需要注意的是，痉挛术后短期内可能会出现一些并发症，比如面瘫、听力障碍、感染、高热等。
面肌的手术可能会损伤到面部的神经，从而导致嘴角歪斜、流口水、口齿不清等症状。伤口部位不注意卫生会导致感染，手术可能会影响到中枢神经的功能，造成短暂的中枢神经功能的紊乱，从而出现高热。随着病情的恢复，并发症会逐渐消失。