木通是不会引起头痛的。本草纲目曰：木通上能通心清肺，治头痛，利九窍。下能泄湿热，利小便，通大肠，治遍身拘痛，所以木通不会引起头痛，而是能治疗头痛。
中草药木通，性味苦寒，具有泻火行水、通利血脉的功效，若是由气滞血瘀所引起的头痛，木通可配伍川芎、桃仁、红花、枳壳、天麻等药物。若是由气血虚弱所引起的头痛，可配伍当归、黄芪、白芍、川芎等药物，具体应用应可依据辨证论治的原则进行加减。
木通尤其是关木通对肾功能有一定的影响，所以应用时一定要遵循医嘱，或者定期监测肾功能。