指甲里有臭味可能是灰指甲，也有可能是甲沟炎引起。
如果指甲里受到了真菌感染后，真菌会分解指甲小皮形成黄色的分泌物。这些分泌物含有大量的真菌，伴随恶臭的气味。取部分分泌物检查，可以确诊真菌的类型，给予抗真菌的药物，例如比萘芬片、伊曲酮康唑胶囊，结合涂抹克霉唑乳膏等药物治疗。
也有可能甲沟炎引起。由于局部受到细菌感染引起发脓也会有臭味，需要给予头孢类或青霉素类的消炎药物控制炎症、杀灭病菌。清理干净脓液，才可以去除臭味。