耳根长包疼的原因有几种：
1.有可能只是耳根部的粉瘤，也叫皮脂腺囊肿，主要是因为皮脂腺腺管阻塞导致，因为皮脂排除障碍会导致堆积在一起形成肿块，而且很容易会造成感染，在感染之后还会形成破溃。对于粉瘤，一般保守治疗很容易会经常复发，最好能够做手术将肿物连带包膜彻底切除。
2.有可能是因为淋巴结发炎导致的肿大，一般是和局部炎症有关，例如咽喉部炎症可能会导致淋巴结发炎，当原发疾病治疗之后，淋巴结发炎情况也会逐渐消退。