导致耳根子疼的原因，常见的有下列几种：
1.神经性的疼痛。患者如果患有牙龈炎、牙周炎或者是龋齿等口腔疾病，导致牙根的神经出现了坏死，有可能会引发靠近耳根，以及口腔等部位的神经出现疼痛表现。
2.耳根部位的炎症病变。如果耳根表面的皮肤因为局部的毛囊细菌感染，引发了毛囊炎或疖肿，有可能会在皮疹发出的时候出现疼痛。
3.患者的耳垂或者是耳根等部位，如果受到了外力的拉扯或者是撞击等伤害，也可能导致局部出现疼痛感。