慢性结肠炎有可能会癌变，癌变发生的几率与疾病的病变范围以及患病的时间有一定的关系。尤其是明确有结肠炎这一疾病，但是患者没有合理用药治疗，并且没有调整患者的饮食习惯、进食习惯、生活习惯，还可能会使癌变发生的风险增大。
该疾病除了会出现癌变这一并发症外，还可能会引起中毒性结肠扩张、溃疡创口、溃疡出血，以及结肠狭窄或者肠梗阻等并发症。
因此，在疾病的早期就需要积极地使用药物治疗，并且调整饮食习惯、生活习惯。