肛瘘主要是因为受到细菌感染引起，大多是由于肛周脓肿破溃后所形成。平时饮食不节，经常吃辛辣刺激性的食物，或者大量喝酒，会容易引起腹泻，而导致局部感染，形成肛周脓肿，最后导致肛瘘的形成。
由于患者抵抗力过低，存在有血液疾病、传染疾病，也会容易引起肛门周围出现病变，而形成肛瘘。另外，炎症性的肠道疾病，比如克罗恩病、溃疡性结肠炎，因为经常炎症的刺激也是形成肛瘘的一个主要因素。
因此，日常需适当锻炼，提高自身的抗病能力，饮食要清淡，注意肛周的清洁和干燥。