肛瘘也是能够做微创手术的，特别是一些低位的肛瘘、简单的肛瘘或者是经括约肌间的肛瘘，可以通过微创的方法进行治疗，比较常用的有LIFT手术方式。
另外还可以通过肛瘘镜进行手术的治疗，也可以使用肛瘘栓进行封堵。肛瘘通过微创手术进行治疗，可以最大程度上保护肛门括约肌的功能，对肛门括约肌不会造成损伤，有效地避免了术后出现肛门失禁的并发症，但是肛瘘通过微创的手术方式增加了复发的可能性。
肛瘘是属于肛门周围感染化脓性的疾病，一般都是由于肛周脓肿发生了溃破发展而来，通过肛门局部的望诊和肛门的触诊就可以初步明确诊断，主要的治疗方式还是以药物或者是手术治疗为主。