细菌性肝脓肿手术费用，各地的收费也是不一样的。以及病变的范围大小以及患者的体质，特别是有基础疾病的患者，手术费用应该是相当高的。
因为不但要治疗肝脓肿，还要考虑患者的体质来综合分析，来确定具体的治疗费用。并且手术的方式也不一样，有的仅仅考虑也可以使用穿刺引流术就可以了，而有的需要进行切开引流。
如果出现比较严重的并发症的，治疗费用应该更高一些。所以要根据情况来综合分析，以及医院的收费标准是不同的。