急性肠炎可能会导致发烧，最高体温可能可以达39℃左右。
出现发烧时，患者还可能会伴有头痛、头晕、乏力以及肌肉酸痛等症状，同时也可能会出现大便次数的增多，以及腹胀、腹痛、食欲下降、精神状态欠佳。在选择用药上，需要根据体温的变化合理使用退热的药物，并且根据疾病的原因，合理使用抗感染药物来缓解症状。
如果明确是受到病毒感染所引起的急性肠炎，不能使用抗生素治疗，而是要使用抗病毒药物以及对症处理的药物，可以选择蒙脱石散等药物来缓解。