吸收不良综合征的主要症状是腹泻，典型为脂肪性腹泻，量大、腻、臭、水或糊状；常伴有厌食、腹胀、肠鸣、排气。吸收不良综合征应根据病因治疗，辅以对症治疗；病因不明者应积极治疗。
经常腹泻的患者可给予解痉药或氯吡胺，以减少腹泻的发生。调整饮食，补充营养、蛋白质、维生素和电解质。如静脉滴注脂肪乳、白蛋白、维生素IDN，含维生素A、D2、E、K1等的乳状液，可溶性维生素ITN，含维生素B1、B2、B6、烟酰胺、泛酸、维生素C、B12、叶酸等的水溶性维生素注射液等，必要时输注血浆或全血。