妊娠期甲状腺毒症对于胎儿和孕妇，都会有一些不良的影响。可以造成流产、妊娠高血压、还有早产、低出生体重儿、胎儿生长受限、死产以及甲状腺危象和孕妇充血性心衰等这些情况。
如果孕妇的甲亢的病因是弥漫性毒性甲状腺肿，还可能会造成新生儿甲亢。所以一般情况下，建议还是要将甲亢纠正到功能正常或者是使用较小的药物维持剂量情况下，再妊娠是比较理想的。
如果在孕期诊断了甲亢，一般建议在孕早期的时候选择丙硫氧嘧啶，孕中期和孕晚期考虑选择甲巯咪唑治疗。