甲亢应该在内分泌科就诊。甲亢属于甲状腺功能异常的疾病，甲状腺功能异常的疾病包括甲亢、甲减。结构异常的疾病，包括甲状腺的结节等，这些疾病都应该就诊于内分泌科。
甲亢的治疗包括抗甲状腺药物治疗、碘-131治疗，以及手术治疗，通常会优先选择抗甲状腺药物治疗。所以，这种疾病应该在内分泌科经过药物的调整进行治疗。
选择碘-131治疗或者是手术治疗，也可以和其他的科室进行联合治疗。例如碘-131治疗要在核医学科进行治疗，而如果选择手术治疗，一般是在普外进行治疗等。