短肠综合征的危害有以下几点：
1.消化不良。短肠综合征在进食后会比正常人排出得要早很多，但是食物一般要经过小肠里面蠕动吸收以及转化才能使其消化，而短肠综合征会因消化不完全，所引起一些食物残渣直接通过大便排出。
2.体重减轻。短肠综合征者会比正常人进食得多，但是因短肠的原因而导致其吸收不良会引起营养不良的后果，食物一般是通过小肠的蠕动，以及吸收转化才能使营养物质得到吸收，吸收障碍进一步就会引起体重的减轻。
3.电解质失衡。短肠综合征有些是天生遗传因素引起，这时往往会比较容易引起电解质的失衡。因此，平常要多注意监测电解质的情况。