引起胎儿畸形的原因有很多，常见的有：
1.遗传性因素，夫妻一方或双方患有一些可以遗传给胎儿的疾病，可以导致胎儿生下来就是畸形。
2.孕期感染 如孕妇在怀孕早期感染风疹病毒、弓形虫、巨细胞病毒可以引起胎儿小头畸形。
3.孕期一些营养素缺乏，如叶酸缺乏是引起胎儿开放性神经管畸形的常见原因。
4.染色体疾病和基因组疾病 如先天愚型、一些真、假两性畸形等。
5.环境因素，孕妇在怀孕早期接触放射线、工业毒物也可以造成先天畸形。
总之，造成胎儿畸形的原因有很多，备孕夫妇应该做好优生优育的充足准备，戒烟酒，预防病毒感染，孕期远离放射性物质等。