首先明确肾穿刺活检是一种有创检查，其并发症以创伤出血为主，不会有生命危险。良好的术前准备，是肾穿刺活检顺利进行和减少并发症的一个重要环节。
常见并发症有：
1.血尿：镜下血尿，发生率几乎百分之百，常于1-5日内消失，无需处理。肉眼血尿发生率2%-16%，大多于1-3日内消失。出现明显肉眼血尿或伴血块时，一般在静点维生素k1或垂体后叶素后可以得到缓解。注意，此时不可使用止血药物，以免出现尿路的阻塞，造成更严重的后果。
2.周围血肿：一般无临床症状，多在1-2周内自行吸收。
3.腰痛：多因血肿、穿刺损伤和卧床时间过长而致，多于1周内消失。
4.动静脉瘘：发生率在15%-19%。其中多数没有临床症状。
5.损伤其他脏器：这种情况极少见。
6.感染：发生率0.2%-2.6%。