新型冠状病毒肺炎患者取肛拭子时，需要专业人员在专业的防护装备下，进行采样，实行一人一采样室，采样后会进行终末消毒。
患者会在采样室内将臀部露出，采取侧卧位或者趴在床上的体位，检查者需要经过专业的培训，并且穿防护服，戴手套、口罩、帽子以及面屏等防护用品。将采样棉签插入肛门约4cm左右的深度，反复擦拭几次后取出，立即放到密封管里封闭，然后进行实验室的检查。取样完毕后会对采样室的空气、地面以及门把手等进行喷洒或者擦拭消毒。