嗓子疼区分咽炎和扁桃体炎主要是通过查体来区分。
咽炎和扁桃体炎引起的临床症状大致相同，都会引起剧烈的咽喉疼痛。但是通过查体可以发现，发生咽炎时，咽后壁皮肤出现充血水肿，有大量的淋巴滤泡增生，患者会有强烈的异物感，伴有许多痰液分泌。而扁桃体炎主要表现为扁桃体充血肿大，局部增生，这是咽炎没有的表现。因此通过查体就可以区分咽炎和扁桃体炎。
在治疗方面两者的治疗方式也大致相同，如果是细菌感染就用抗生素进行治疗，如果是病毒感染就用抗病毒药物治疗。