内分泌失调引起的肥胖，又称之为继发性肥胖，一般继发于神经内分泌代谢紊乱基础上的肥胖症，有如下的疾病，下丘脑疾病、垂体疾病、胰岛病、甲状腺功能减退症、肾上腺皮质功能亢进症、性腺功能减退症以及水钠潴留型肥胖及痛性肥胖等等。
出现了这些肥胖症，是需要治疗原发病，肥胖就会得到明显的改善。比如多种原因引起的下丘脑综合征，包括炎症、后遗症、创伤、肿瘤和肉芽肿，均可引起肥胖症。
治疗以上疾病肥胖就会得到缓解，甲减，也会造成患者的粘液性水肿，看起来有肥胖的表现，治疗甲减纠正后，肥胖也会明显缓解。