有卵巢囊肿怀孕几率的大小，与卵巢囊肿的大小、一侧还是双侧、良性还是恶性、女性的年龄都有很大的关系。
对于生育期女性，如果是一侧的卵巢囊肿，尤其是考虑生理性的卵巢囊肿，无其他不孕的因素，怀孕的几率是很大，与正常女性是一样。
对于双侧的卵巢囊肿，尤其是囊肿很大，卵巢的皮质功能影响很大，无明显的卵泡，这种情况就会影响女性怀孕，甚至怀孕几率是很低。尤其是恶性肿瘤，甚至不能保留卵巢及子宫，就没有生育的可能。
因此，对于卵巢囊肿对怀孕几率的影响需要多方面考虑。如果卵巢囊肿影响女性的卵巢排卵就会明显影响怀孕。