有些卵巢囊肿是可以怀孕的。比如一些比较小的囊肿，或者是一些生理性的小囊肿，一般不会引起卵巢功能的异常，不会影响怀孕。但是如果卵巢囊肿比较大，一般还是建议在怀孕前行卵巢囊肿剥除。
有些比较大的卵巢囊肿，容易在怀孕的过程当中被增大的子宫挤压，会导致卵巢囊肿蒂扭转、卵巢囊肿破裂，这个时候就会增加怀孕的风险，尤其是在孕早期，容易引起流产。如果做手术，麻醉的过程中可能会影响胎儿。还有些卵巢巧克力囊肿，会影响排卵功能，容易引起不孕，所以也是建议先进行卵巢囊肿手术治疗以后再怀孕。
卵巢囊肿是否可以怀孕，要根据卵巢囊肿的性质，还有卵巢囊肿的大小来决定。