化脓性食管炎可以吃头孢，也可以选择青霉素或者是庆大霉素等抗炎药物治疗。主要是要选择针对革兰阳性菌较为敏感的抗炎药物，可以缩短该疾病的治疗时间。有条件时也可以根据药物的敏感试验选择抗生素。
如果患者吞咽疼痛，或者是胸骨后疼痛症状较为严重。也可能需要给患者合理使用质子泵抑制剂以及H2受体拮抗剂。可以给患者使用奥美拉唑、泮托拉唑以及西咪替丁等药物。
如果该疾病已经累及食管的周围组织，有可能需要给予手术治疗。