尿毒症患者的并发症主要包括高血压、肾性贫血、继发性甲状旁腺功能亢进以及高脂血症等。尿毒症的患者的并发症，其中高血压有的是容量依赖性高血压，有的是肾素依赖性高血压，需要区分对待。而肾性贫血，它的产生有多种原因如尿毒症患者导致的慢性肾功能不全，从而引起红细胞生成原料缺乏，如铁、叶酸、维生素B1的缺乏。还有红细胞寿命缩短和失血，包括胃肠道失血,以及尿毒症的毒素，包括甲状旁腺毒素抑制骨髓红细胞生成等。但最主要的原因是慢性肾功能不全时肾脏促红细胞生成素的生成减少。
此外，尿毒症的并发症还包括慢性肾脏病-矿物质及骨代谢异常。慢性肾脏病-矿物质及骨代谢异常患者在肾功能进行性丧失的过程中会出现矿物质和骨代谢异常的表现，其为多系统的病变。主要表现为高磷血症、低钙血症、血清碱性磷酸酶增高、甲状旁腺功能亢进以及血清25羟维生素D3降低等。