盆底综合症引起的结肠炎，没有特殊有效的治疗药物，如果患者出现了反复的便秘等症状时，可以使用缓泻剂，并且要适当的多吃含膳食纤维比较多的食物，对于症状的缓解有一定的作用。
如果出现了反复的腹痛，或者是大便次数增多时，也有可能需要及时的给予口服抗感染药物，以及对症处理的药物，具体药物的用法用量，要在临床医生的指导下应用。
除此以外，还需要在医生的指导下，进行训练活动，特别是针对盆底肌的训练，对于疾病的恢复有促进作用。