高位的肛周脓肿还是有一定的复发几率的。
高位的肛周脓肿位于肛门括约肌上方，因为位置比较高，手术探查比较困难，而且脓腔不能得到充分彻底的引流，会在局部形成死腔，时间长了，脓腔不能愈合，就会逐步发展成为高位的肛瘘，肛瘘的感染持续存在。如果感染加重，就会形成新的肛周脓肿。所以要想将肛周脓肿彻底治愈，还是需要较高手术水平的肛肠科医师才能进行。
在进行高位的肛周脓肿手术之前，最好是先进行磁共振强化检查，以确定脓肿的位置与周围组织的关系，有条件的还可以进行肛内彩超检查，彩超检查可准确的定位脓肿的内口，以降低术后发病的几率。