射精后腰酸痛的发生原因，可能跟前列腺、精囊腺等部位感染有关。相关附属性腺体受到病菌感染，引发的腰痛是症状之一。由于射精过程中相关附属性腺体压力加大，可进一步加重射精后腰痛。
射精后腰痛的另一可能原因，跟腰部肌肉损伤有关。由于性过程中腰部肌肉运动量较大，女方性体位选择不当、动作粗暴，或者是过度频繁安排性生活，可导致腰部肌肉劳损，发生射精后腰痛感觉加重。
可结合伴随症状，针对性选择前列腺液化验、腰椎拍片等检查，明确射精后腰痛的疾病原因。