肛裂按病程的长短分为急性肛裂和慢性肛裂，其治疗方法也并不相同。
急性肛裂大多采用药物的保守治疗，首先患者应该通过改善饮食，多吃蔬菜、水果等粗纤维的食物，避免辛辣刺激性的食物，保持大便的通畅和软化，防止便秘的发生。局部可以使用太宁栓塞肛门，外用马应龙痔疮膏等等促使肛裂裂口愈合。
而慢性肛裂由于裂口形成慢性溃疡，裂口偏深，周围已经形成纤维化，所以经用药的保守治疗效果并不佳，需要考虑行手术治疗，可以行肛裂切除术加肛门内括约肌部分切断术。