脑萎缩的最佳治疗方法是以药物治疗为主，可以应用胆碱酯酶抑制剂多奈哌齐、卡巴拉汀、加兰他敏等药物，有改善认知功能的作用。
伴有脑血管疾病，有半身不遂、语言障碍的病人，也可以用银杏提取物以及扩张脑血管的药物治疗，可以口服脑蛋白水解片或者用脑蛋白水解物输液治疗，因为有调节和改善神经元代谢的作用，能够保护脑细胞和营养脑细胞。
对曾经受过脑外伤的病人，可以用吡拉西坦、奥拉西坦等药物。脑萎缩的病人也可以应用神经生长因子治疗，多吃一些核桃、坚果类的食物，花生、牛奶、豆制品、鱼肉等食物。