1.及时治疗引发肛瘘的疾病，如肛窦炎、肛隐窝炎等肛管疾病。
2.合理饮食，少吃辛辣、刺激性食物和油腻、煎炸食物，多吃清淡易消化食物和富含纤维素的食物。
3.肛门出现灼热、不适或伴有疼痛、肛门坠胀感，要及时查明是否肛瘘前期肛周脓肿阶段，及时治疗。
4.防止腹泻和便秘，便秘时，粪便干硬，容易擦伤肛管、肛窦处细菌侵入引发感染。腹泻多伴有直肠炎和肛窦炎，容易引发肛瘘。
5.积极治疗溃疡性结肠炎和克罗恩病，防止继发肛瘘形成。
6.保持肛周清洁卫生，便后温水清洗坐浴。