化脓性门静脉炎的病因主要是腹腔脏器感染。血液通过静脉进入门静脉，炎症是门静脉植入引起的，也有细菌从远处的血线转移到门静脉。由于门静脉扩张引起的化脓性静脉炎一般为细菌性，故应根据不同的病因选择不同的治疗方法。
如果体表有些感染，应选择对阳性球菌敏感的抗生素。对于腹腔脏器感染引起的门静脉炎，应选用抗厌氧菌、抗链球菌和抗菌消炎药进行抗炎治疗。因为是细菌性炎症，所以抗炎治疗是可以的，但应定期复查，看是否有门静脉炎引起肝脓肿和肝内感染。