长期反复发作的肛瘘会有极低的概率发生恶变，引起恶性肿瘤。
肛瘘是肛门周围软组织的一种慢性化脓性疾病，常继发于肛周脓肿之后形成，可以分为单纯性肛瘘和复杂性肛瘘。单纯性肛瘘有一个内口和一个外口，内外口之间由瘘管在皮下相通，而复杂性肛瘘可以有多个外口。
肛瘘可引起肛门软组织的慢性炎症，反复发作，经久不愈。单纯性的肛瘘，也有可能逐渐发展成复杂性的肛瘘。长期慢性的炎症刺激，有极低的概率会导致皮肤细胞恶变，引起皮肤恶性肿瘤，手术是唯一能够根治肛瘘的方法。