导致患者睡醒后头疼症状的原因有很多，需要查明病因后进行对因对症治疗。
如果患者是因为长时间睡眠引发的头疼，可以考虑和神经失调有关，是由于在睡眠的过程中神经处于一种抑制状态，当睡醒后由于神经兴奋度不能短时间内恢复而引发的头疼表现，建议注意休息，一般通过自身调理上述症状可以消失。如果患者睡觉期间因为着凉引起了感冒发烧症状，头疼可以考虑和感冒发烧有关，发烧期间需要选择退烧药进行治疗，感冒症状明显时需要使用感冒药进行治疗，必要时可以使用脑宁片等一些止痛药物缓解症状。
如果患者头疼持续的时间较长，不排除和一些颅内器质性疾病有关，建议去医院神经内科检查就诊。