胃肠道间质瘤和子宫内膜间质肉瘤不一样。胃肠道间质瘤属于消化系统疾病。子宫内膜间质肉瘤属于妇科疾病，发病部位是不相同的。两者的症状也不相同。
胃肠道间质瘤，是罕见的软组织肉瘤，来源于胃肠道间叶组织。早期往往没有明显的症状，对人体不会有太大的影响，体积较大的胃肠道间质瘤可引起恶心、呕吐、食欲下降，甚至吞咽困难、呕血、腹部疼痛有包块。
子宫内膜间质肉瘤分为低度恶性子宫内膜间质肉瘤和高度恶性子宫内膜间质肉瘤，主要表现为阴道流血、月经量增多、贫血、下腹疼痛等症状，主要以手术及后续化疗治疗为主。