自身免疫性胰腺炎不会出现肝脏转移，该疾病在临床当中比较少见，胰腺炎有可能会影响到肝脏，引起肝脏损伤时，可能会出现转氨酶的升高，因此在治疗时要注意观察患者的肝功能情况，必要时需要给患者加用保肝的药物，促进疾病的恢复。
该疾病典型的临床表现就是梗阻性、无痛性的黄疸，也可能会出现急性弥漫性的胰腺炎症状，引起糖尿病，并且体重下降，有可能会出现脂肪泻。
该疾病主要的治疗方式是激素治疗，如果使用激素治疗疗效不好，则要考虑有病变的可能性。