十二指肠炎一般不会引起肝区疼痛。该疾病典型的疼痛位置，应该是在上腹部疼痛，有可能还会出现胃灼热感，也可能会导致患者出现反酸、嗳气，以及恶心、呕吐。
部分患者还可能会与十二指肠溃疡的临床表现大致相同，可能会出现规律性的上腹部疼痛，进食后疼痛可能会有所减轻。部分患者，还可能会出现上消化道出血的症状，表现为呕血、黑便，以及贫血等症状。
随着疾病的进展，并且没有及时地使用药物治疗时，还可能会导致患者出现十二指肠穿孔，以及幽门梗阻等疾病临床表现。