首先，两者性质不同，黄柏为黄皮树的干燥树皮晾干，盐黄柏是经过盐水炮制，制作的方法不同。
其次，作用不同，黄柏擅长苦寒沉降，能清热燥湿、泻火解毒。中医认为咸味能入肾，经过盐炮制后的黄柏更能入肾经，治疗肾阴虚火旺导致的遗精、阳痿等，善于治疗下腹部的湿热、小便黄、口苦等下焦湿热症。
中药的不同炮制方法能很大程度上影响到药物的效果，建议在医师的指导下使用。要注意之间的区别，在选用时选择最适合的针对自身疾病功效最强的一种来使用。