艾灸的时间并不固定，时间的长短要取决于病情。
一般艾灸大多数控制在15分钟至1个小时不等，对于外感表证，例如风寒感冒，汗出就要停灸。而某些急性病症，如因进食生冷导致的急性胃肠炎、急性腹痛等可以时间稍短一些，做到症状缓解就可以。
对于一些慢性病如慢性关节炎、慢性支气管哮喘，可以每天艾灸时间稍长。此外，头面部穴位艾灸时间建议控制在5-10分钟，因为头面部血管比较丰富。腹部穴位可以延长施灸时间，因为腹部有较厚脂肪组织，热力渗透要慢一些。