HPV疫苗接种后一般不会出现腹泻。个别女性接种HPV疫苗后出现腹泻现象，可能是由于其胃肠功能状态不好，HPV减毒活病毒刺激胃肠，导致胃肠功能紊乱，引起腹泻症状。
HPV疫苗基本上是安全的，不良反应少，可以放心接种。接种HPV疫苗后，少部分人可能会出现头晕、乏力、胸闷、气紧、腹泻等不适症状。如果症状轻微，不需要特殊处理，2~3天后会逐渐消退。如果症状比较重，应该及时就医。
接种完HPV疫苗后，要就地观察30分钟，无不适症状者，方可离开接种地点。如果出现不适症状，要及时与医生沟通。患有腹泻等疾病的女性，应该等身体康复后才能接种HPV疫苗。