肠结核与克罗恩病的区别在于疾病的原因以及临床表现、治疗方式。
肠结核是受到了结核杆菌的感染导致，克罗恩病是一种病因不是很明确的一种肠道炎症感染性疾病。在临床表现上，虽然都会出现腹痛、腹泻，但是克隆罗恩病没有结核中毒症状。
肠结核有可能会出现反复的低热、乏力、盗汗等症状，克罗恩病也可能会出现肠道以外的临床表现，有可能会出现关节的红肿、热痛以及口腔炎、强直性脊柱炎等疾病。
在治疗上肠结核主要是根据患者的临床表现，合理使用抗结核药物，而且使用药物的治疗时间较长，需要严格遵守抗结核药物的使用药物原理才能使症状缓解。