心肌炎是由多种因素造成心肌细胞的损伤引起的，大多数的心肌炎的预后是比较好的，经过积极治疗是可以治愈的。
只有少数的心肌炎可能会由于心肌的损伤比较严重，会遗留有后遗症，比如可能遗留有心脏功能不全或心衰，也可能遗留有各种类型的心律失常。比如房性早搏、室性早搏、房室传导阻滞，严重的还有可能发生高度或三度房室传导阻滞。
患者需要安装起搏器才能维持正常的心脏功能，少数患者可能会出现心腔的持续的扩大，出现心力衰竭，极少数的暴发性心肌炎有可能发生猝死。