很多原因可以造成心肌炎，比如病毒感染、细菌、立克次体、原虫、蠕虫等引起的心肌炎为感染性心肌炎。非感染性心肌炎包括药物、毒物、放射、结缔组织病、结节病等。
但是心肌炎最常见的病因还是病毒感染。病毒感染以后，一方面可以造成心肌的直接损伤，另一方面可以介导免疫损伤，造成心肌损害和微血管损伤。这些都可以损害心肌组织的结构和功能，导致心肌炎的发生。
大多数心肌炎病程多为自限性，但是也有的进展为扩张型心肌病。暴发性心肌炎或者是重症心肌炎，可以导致急性心衰、恶性的心律失常等。