贲门失弛缓症的确诊，需要根据患者的疾病临床表现，以及相关的辅助检查结果来判定。该疾病典型的临床表现是吞咽困难，最初可能是偶尔出现吞咽固体，以及流质食物出现困难。随着疾病的进展或者情绪的紧张，可能会在每餐，甚至每次吞咽时，都可能出现吞咽困难，同时也会出现自发性的胸骨下疼痛或者反流呕吐。
辅助检查主要是给患者做食管钡餐造影，这是该疾病比较重要的一种诊断性的检查，通过该检查，可以会发现食管体部蠕动消失，吞咽时远端的括约肌失松弛反应。