黄连具有清热燥湿、泻火解毒的功效。
黄连性味苦寒，是黄芩、黄连、黄柏这三黄组合中最苦的一味药，也是清热燥湿之力最强的一个，黄连善于清利中焦脾胃以及大肠的湿热，对于患者由于大肠湿热，而出现的泻痢以及呕吐症状，疗效极其显著。当患者胃火炽盛时，容易出现胃痛、呕吐吞酸、消谷善饥、烦渴等症状，用黄连搭配半夏、竹茹、吴茱萸等药物，可以有效清泻胃火。
此外，黄连在治疗心火炽盛导致的各种神志病，以及出血症状中也是一味良药。现代研究表明，黄连中含有的小檗碱，还有清热、降血糖、强心、降脂等作用。