脑积水的治疗应该首选解除脑脊液循环通路梗阻。所以手术治疗是唯一的选择。而药物治疗只能暂时缓解症状。脑积水的手术治疗，主要方式是进行脑室分流，以及脑室镜下第三脑室造口术。
脑室分流通过改变脑脊液的循环途径，将脑脊液分流到人体的体腔被吸收。其中脑室腹腔分流适用于各种类型脑积水，是目前应用最广的术式。脑室引流管最好放置在额角，经颈部、胸壁皮下达到腹部，在剑突下正中做腹壁一小切口，将导管引入到腹腔当中。它的主要并发症是有可能出现感染，包括切口感染以及颅内感染，导管堵塞，导管移位。比较少见的并发症是有可能引起肠梗阻。