化脓性食管炎能否自愈，可能与患者脓肿的大小以及个人的身体状况有一定的关系。
如果病灶局限，形成单个黏膜下脓肿，精神状态良好，个人身体素质较好时，可以自行痊愈。
如果患者症状较为严重，有形成多个黏膜下脓肿、脓肿较大，并且有累及食管周围组织，此时自行痊愈的可能性较小。需要及时地给患者使用广谱抗生素治疗，也可以根据药物的敏感试验结果选择。假如通过广谱的抗炎药物症状没有改善，脓肿逐渐增大时，有可能需要给予切开引流。部分患者还可能需要做食管切除手术。