肛周脓肿和肛瘘是同一个疾病的两个不同发展阶段，早期是肛周脓肿，后期形成肛瘘，二者既有联系又有区别。
肛周脓肿会在肛周发现一肿块，伴有疼痛，逐渐加重，疼痛剧烈时患者坐卧不安、食欲不振，伴有发热。深部肛周脓肿还会出现寒战、高热、肛门下坠、排尿困难、会阴及骶尾部胀痛等症状，得了肛周脓肿要及时手术治疗。
肛瘘一般是肛周脓肿破溃或切开引流后引起的，主要症状是外口流脓、肛周潮湿、瘙痒，外口闭合时还会出现肿胀和疼痛。