骶管囊肿的治疗，目前主要由临床观察、外科手术治疗以及药物治疗。首先就是临床观察，大部分的骶管囊肿是没有任何临床症状的，如果没有症状，骶管囊肿是不需要处理的。也就是说可以临床观察的。
第二种治疗方法是药物治疗。有一部分的骶管囊肿病人症状比较轻微。也不影响日常的生活。这部分病人可以使用一些神经营养的药物以及止痛的药物。但是药物治疗只能够缓解症状，达不到治愈的目的。也就是常说的指标，但是不能够治本。
第三种方法是外科手术治疗。对于产生了明显症状的骶管囊肿，就需要行外科手术治疗，手术是在显微镜下进行的精细操作。